Edson, verifique suas entradas na J1BTAX para a combinação destino-destino, ou seja, na mesma tabela em que a condition ISIC é determinada, lá também se determina a base (no destino), pois segue a seq. de acesso como se fosse de uma ST.
A entrada de redução que vc fez se refletiu no ICMS normal. (que tem chave origem-destino) e não destino-destino.
É mesma lógica que se usa no caso de ST.
Abraço,